Statistiques de thèse de médecine : les faire soi-même ou demander de l’aide ?

Au moment d’analyser les données d’une thèse de médecine, beaucoup d’étudiants se posent la même question : puis-je faire les statistiques moi-même, ou dois-je demander l’aide d’un statisticien ?

La réponse courte : vous pouvez réaliser vous-même des analyses simples si votre question, votre base et vos tests sont clairs. En revanche, dès que le plan d’analyse se complexifie, il faut demander de l’aide tôt. Le logiciel ne compense pas une mauvaise méthode.

Cet article vous donne une grille de décision. Il s’inscrit dans la section statistiques du guide complet de la thèse de médecine et complète le comparatif des logiciels pour les statistiques d’une thèse.

La réponse courte : trois niveaux d’autonomie

Il ne faut pas opposer brutalement “je fais tout seul” et “je délègue tout”. En pratique, il existe trois niveaux.

Situation	Ce que cela signifie	Exemple
Faire soi-même	Vous réalisez les analyses avec un outil guidé, après avoir compris le plan d’analyse	description de population, comparaison simple de deux groupes
Demander un avis ponctuel	Vous gardez la main, mais vous faites valider un point méthodologique	choix du test, gestion des valeurs manquantes, interprétation d’un résultat
Faire appel à un statisticien	La stratégie d’analyse ou les modèles nécessitent une expertise dédiée	modèle multivarié, données longitudinales, appariement, survie, score prédictif

L’objectif n’est pas de prouver que vous savez tout faire. L’objectif est de produire une analyse correcte, compréhensible et cohérente avec la question de recherche.

Ce que “faire ses statistiques soi-même” implique vraiment

Faire ses statistiques soi-même ne signifie pas seulement cliquer dans un logiciel. Cela implique de comprendre au minimum :

• quelle est la population analysée ;
• quel est le critère de jugement principal ;
• quelles variables doivent être décrites ;
• quelles comparaisons répondent réellement à la question ;
• quelles données sont manquantes ;
• quel test statistique est adapté ;
• comment présenter les résultats dans le manuscrit.

Un outil comme TablR, Jamovi ou JASP peut rendre l’analyse plus accessible. Mais l’outil ne décide pas à votre place. Si vous comparez les mauvais groupes, si vous mélangez des variables mal codées ou si vous ignorez un biais majeur, le logiciel produira quand même un résultat.

Les situations où vous pouvez raisonnablement avancer seul

Vous pouvez souvent avancer seul si votre thèse correspond à l’un de ces cas :

• étude descriptive simple ;
• comparaison de deux groupes indépendants avec peu de variables ;
• questionnaire avec résultats essentiellement descriptifs ;
• analyse rétrospective monocentrique avec critères clairs ;
• tableau de caractéristiques de population ;
• calculs simples de proportions, moyennes, médianes et intervalles de confiance.

Même dans ces situations, il faut rester rigoureux. La base doit être propre, les variables doivent être documentées, et les valeurs manquantes doivent être codées de façon explicite.

Avant de lancer les analyses, vérifiez :

• que votre tableur de recueil est exploitable ;
• que vos valeurs manquantes sont identifiées ;
• que le test choisi répond à la question posée ;
• que vous savez expliquer le résultat avec vos mots.

Si vous ne pouvez pas expliquer ce que fait le test, il faut au moins demander un avis.

Les situations où il faut demander de l’aide

Demandez de l’aide si votre projet comporte l’un des éléments suivants :

• comparaison de plusieurs groupes avec ajustements ;
• données appariées ou mesures répétées ;
• suivi dans le temps ou analyse de survie ;
• modèle multivarié ;
• score prédictif ;
• nombreux facteurs de confusion ;
• données très manquantes ;
• petit effectif avec interprétation délicate ;
• objectif de publication scientifique ;
• désaccord entre les résultats attendus et les résultats obtenus ;
• incertitude sur le nombre de sujets nécessaires.

Ces situations ne rendent pas votre thèse impossible. Elles signifient simplement que le choix méthodologique compte autant que le logiciel.

Pour certains cas, vous pouvez déjà lire les articles dédiés : comparer deux groupes ou plus, analyser des données appariées ou créer un score prédictif.

Quand contacter un statisticien ?

Le meilleur moment est avant le recueil, au moment du protocole.

Un statisticien ou un méthodologiste peut vous aider à clarifier :

• le critère de jugement principal ;
• les critères secondaires ;
• les variables à recueillir ;
• la structure du tableur ;
• le nombre de sujets nécessaires ;
• les analyses prévues ;
• les analyses de sensibilité ;
• la gestion des données manquantes.

Attendre la fin du recueil est risqué. À ce stade, certaines erreurs ne sont plus vraiment réparables : variable non recueillie, critère mal défini, effectif insuffisant, groupes trop déséquilibrés, données impossibles à chaîner.

Si votre projet nécessite une justification d’effectif, consultez aussi l’article sur le nombre de sujets nécessaires dans une thèse. Ce sujet se discute avant le recueil, pas après.

Comment préparer une demande d’aide efficace

Les ressources méthodologiques institutionnelles sont souvent limitées. Plus votre demande est claire, plus il sera facile de vous aider.

Avant de contacter un statisticien, préparez :

1. votre protocole de thèse ;
2. votre question de recherche ;
3. la population étudiée ;
4. les critères d’inclusion et d’exclusion ;
5. le critère de jugement principal ;
6. la liste des variables recueillies ;
7. un dictionnaire des variables ;
8. un extrait anonymisé ou fictif de la base ;
9. les analyses que vous pensez réaliser ;
10. les points qui vous posent problème.

Ne venez pas seulement avec “j’ai besoin de stats”. Venez avec une question : “quel test utiliser pour comparer ce critère entre ces deux groupes ?”, “faut-il ajuster sur ces variables ?”, “comment traiter ces données manquantes ?”.

Vous pouvez utiliser Analyse Sujet pour préparer une première reformulation de votre projet et clarifier la discussion. Ce n’est pas un avis statistique, mais cela peut vous aider à présenter votre demande.

Que faut-il mentionner dans le manuscrit ?

Si vous faites appel à un statisticien, ou si une personne vous aide de façon substantielle sur la méthode ou les analyses, il faut le mentionner.

Selon le contexte, cela peut apparaître :

• dans les remerciements ;
• dans la section Méthodes, pour préciser le logiciel et les analyses ;
• dans une section “contributions” si le format le prévoit ;
• dans la discussion avec les limites méthodologiques éventuelles.

Le point important est la transparence. Faire appel à de l’aide ne diminue pas la qualité de votre thèse. Au contraire, cela peut renforcer la crédibilité du travail si l’aide est correctement intégrée et que vous comprenez les analyses réalisées.

En revanche, déléguer l’analyse ne vous dispense pas de savoir interpréter les résultats. Vous devez pouvoir expliquer les grandes lignes : population analysée, test utilisé, résultat principal, incertitude, limites.

Quel outil utiliser si vous faites une partie vous-même ?

Pour des analyses simples, commencez par un outil accessible.

Besoin	Outil possible
Analyses guidées de thèse, import de tableur, tableaux de résultats	TablR
Analyses classiques avec interface installée	Jamovi ou JASP
Préparation et contrôle de base	Excel ou LibreOffice Calc
Analyses reproductibles et apprentissage avancé	R
Data science ou automatisation	Python

Le comparatif détaillé est disponible dans l’article quel logiciel utiliser pour les statistiques d’une thèse de médecine.

Checklist de décision

Vous pouvez probablement avancer seul si :

• votre objectif est descriptif ;
• votre base est propre ;
• vos variables sont simples ;
• vous avez peu de valeurs manquantes ;
• le test statistique est évident ;
• vous savez expliquer le résultat.

Demandez au moins un avis si :

• vous hésitez entre plusieurs tests ;
• votre effectif est faible ;
• vos groupes sont déséquilibrés ;
• vos données sont appariées ou répétées ;
• vous avez beaucoup de données manquantes ;
• vous prévoyez une régression ou un modèle multivarié.

Faites appel à un statisticien si :

• l’analyse conditionne la validité de la thèse ;
• le projet vise une publication ;
• le protocole nécessite un calcul d’effectif ;
• les données sont complexes ;
• vous ne savez pas formuler un plan d’analyse.

En pratique

Commencez par écrire ce que vous voulez démontrer ou décrire. Ensuite seulement, choisissez l’outil ou la personne à solliciter.

Si votre étude est simple, un outil guidé comme TablR peut vous permettre d’avancer efficacement. Si votre étude est plus ambitieuse, demandez de l’aide tôt, idéalement avant le recueil.

Le bon objectif n’est pas de faire seul à tout prix. Le bon objectif est d’obtenir une analyse rigoureuse, explicable et cohérente avec votre protocole.

Questions fréquentes

Est-on obligé de faire ses statistiques de thèse soi-même ?

Non. Vous pouvez réaliser certaines analyses vous-même, être accompagné ponctuellement ou faire appel à un statisticien. L’important est de comprendre les choix réalisés et d’être transparent dans le manuscrit.

Quand faut-il contacter un statisticien pour une thèse ?

Le plus tôt possible si l’étude est comparative, prospective, multivariée, longitudinale, appariée, ou si le nombre de sujets nécessaires doit être justifié. Attendre la fin du recueil limite fortement les possibilités de correction.

Peut-on utiliser TablR, Jamovi ou JASP sans statisticien ?

Oui pour des analyses simples si la question, les variables et les tests sont clairs. Mais un outil intuitif ne remplace pas la compréhension méthodologique ni la validation d’un plan d’analyse complexe.

Que faut-il préparer avant de demander de l’aide ?

Préparez la question de recherche, le protocole, la population, les critères de jugement, le dictionnaire des variables, l’état du recueil et la liste des analyses envisagées.

Faut-il mentionner l’aide d’un statisticien dans la thèse ?

Oui, si une personne a contribué aux analyses ou aux choix méthodologiques, il faut le mentionner de façon adaptée dans les remerciements, la méthode ou les contributions selon les règles locales.